Vapaakirkko on omaksunut Uuden testamentin opetuksen Jeesuksen takaisin tulosta. Tämän mukaan takaisin tulo muodostuu kahdesta toisistaan selvästi erottuvasta osasta.
Ensin Jeesus tulee noutamaan omansa, sekä kuolleet että elävät. Tuhannen vuoden kuluttua tästä hän tulee tuomarina kaikille.
Uskovien seurakunta elää Herran takaisinpaluun odotuksessa. Vaikka se ei tiedä Jeesuksen takaisintulon tarkkaa aikaa, se valmistautuu kuitenkin tätä suurta päivää varten. Uskoville Herran paluu tulee odotettuna tapahtumana. Vaikka Jeesuksen takaisin tulon aikaa ei tiedetä eikä sitä haluta päivittää, niin seurakunnalle se on niin suuri tapahtuma, että sitä kannattaa odottaa.
Jeesuksen takaisin tulon päivää odottaessa seurakunta julistaa koko maailmalle, että Jumala on avannut Kristuksessa kaikille mahdollisuuden pelastukseen ja iankaikkiseen elämään.